Chytridiomycota (del griego quitridio, que significa “cacerolita”): Son los hongos más primitivos.
La mayoría son acuáticos y viven asociados a plantas e insectos. Son pluricelulares de muy pequeño tamaño, incluso algunos de ellos son unicelulares. Son mayormente saprofitos (degradando quitina y queratina). Pueden infectar plantas y anfibios, y generar enfermedades graves.

La especie más ampliamente estudiada ha sido Batrachochytrium dendrobatidis pues es la responsable de la extinción de diversas poblaciones de anfibios en todo el mundo, principalmente Centro y Sudamérica.