Los aminoácidos se enlazan unos con otros mediante el llamado enlace peptídico. El enlace peptídico:
- Es un enlace covalente amida que se establece entre el grupo hidroxilo de un a.a. y el nitrógeno del grupo amino de otro aminoácido.
- En este caso (O-glucosídico y éster también) se condensa una molécula de agua.
- Los átomos directamente implicados en el enlace se sitúan en un mismo plano.
- Presenta polaridad debido a la electronegatividad del oxígeno y del nitrógeno, lo que permite formar enlaces de puente de hidrógeno, un factor clave para la estructura secundaria de las proteínas (como la hélice α y la lámina β).
- Por convenio los aa se nombran desde el N-terminal hasta el C-terminal y se escriben de izquierda a derecha en el orden que ocupen en la cadena.
Los aa unidos por enlaces peptídicos se conocen como residuos, para resaltar la pérdida de átomos en la formación del enlace. Según el número de aa que se unan, los polímeros resultantes se denominan péptidos:
- DIPÉPTIDOS
- TRIPÉPTIDOS
- OLIGOPÉPTIDOS (de 4 hasta 10 aa)
- POLIPÉPTIDOS (más de 10 aa)
- PROTEÍNA (más de 50 ó 100 a.a).

Un p´´éptido es cualquier molécula formada por la unión de una cadena generalmente corta de aminoácidos (dipéptido, tripéptido, oligopéptido, polipéptido). Si cuenta con más de 50 ó 100 aa puede plegarse y tener estructura terciaria y pasan a llamarse proteínas.
Nota: Algunas clasificaciones sin embargo consideran que un oligopéptido es hasta 50 aa y un polipétidos entre 50 y 100 aa. Nosotros utilizaremos la reseñada anteriormente.
Este enlace posee unas características concretas:

- El enlace peptídico es un enlace covalente más corto que la mayor parte de los demás enlaces C-N; por esta razón tiene carácter parcial de doble enlace, lo que evita la rotación a su alrededor y restringe la conformación de la cadena polipeptídica.
- Los cuatro átomos (C=O, N-H) se hallan situados sobre un mismo plano, manteniendo las distancias y ángulos fijos. Los únicos enlaces que pueden girar, y no del todo libremente, son los formados por C-C y N-C.













